|赵洪鑫:一键完成倾向性评分匹配并自动生成Word版图表用于论文
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作者:赵洪鑫 复旦大学医学博士 北京洪宇科技有限公司CEO
这是一个全自动做倾向性评分匹配(PSM)的工具 。
大家可能会问 , SPSS不就可以做PSM , 还开发这个工具有啥意义?主要在于几点:
1)瞬间自动生成匹配前后基线特征表和love plot 。
2)可以边看匹配后的结果表格边调匹配参数 , 实时调整结果 , 所见即所得 。
3)自动生成Word报告 , 论文里需要的图表一分钟给您全部准备好 。
4)集成数据管理工具、缺失数据处理工具 , 生成匹配后的数据下载做进一步分析 。
所谓倾向性评分匹配 , 用粗俗的话说来就是在非随机对照研究中 , 因为没有随机分配患者 , 所以观察组和对照组基线特征有差异 , 俗称基线不平衡 。 会使得读者质疑你的疗效分析结果 。 所以我们只好牺牲一些样本量 , 从对照组中选择一部分和观察组基线差异较小的患者 , 来进一步分析疗效(有时候为了效果 , 观察组也要牺牲掉一部分样本) 。
从对照组里选择哪些患者 , 才能缩小和观察组的差异呢?交给计算机自动处理就行 , 自己不用操这个心了 。
进入下面这个网站 , 选择倾向性评分匹配工具来进行:
第一步 , 根据提示先下载样例excel , 准备您的数据:
www.b-hy.com/ai
应该包括ID号 , 代表组别的变量如group 以及需要调整和匹配的协变量如age gender smoke diagnoseprogram等 。 应当注意的是 , 代表组别的变量 下面只能包含两个组 , 如\"Treatment\" , \"Control\" 或者GroupA GroupB等 。 不能包含两个以上组 。 三组的PSM本工具暂不提供 , 会重新研发一个工具 。
将准备好的数据导入系统:
上传之后看一下没有问题 , 一定要点击最下方的 “import data” 按钮才能下一步 。
下一步点击上方的 “选择字段” 标签:
这一步非常重要 , 关系到PSM的处理方式 , 不能略过 。 需要对变量的标签和属性做一些调整 , 另外设置一下 , 连续性变量设置为numeric 分类变量设置成character 。 比如stage这个变量 , 是个数值型 , 取值我们在右边看到只有1234 , 其实代表的是疾病分期 , 只是一个分类变量 , 并不是一个连续变量 , 这时候我们务必要把字段的属性在New class菜单里设置为“character” , 后续才能正确处理 。
字段名称可以改成最终统计表里的名称 , 比如 age 可以改成 Age 首字母大写等等 。
然后在这个页面 , 哪怕你什么也没修改 , 也务必要点击“Apply Changes” 按钮 , 才能进入下一个页面 , 否则进行不下去 。
下一步可以点击“选择患者” , 如果要选取一部分患者做亚组分析的话 , 在这个页面做选择和调整 。 如果没有需要则直接下一步 。
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