许东的「AI生命科学」进化史:从90年代泡沫繁荣,到深度学习复兴( 三 )


既然实验不成功 , 许东也不再硬着头皮做 , 他开始想着兑现自己的理论天赋 , 经常在硕士论文中顺着几个实验结果自我发挥 , 写出十几张纸的理论猜想 。
在导师看来 , 这些猜想毫无根据 , 多次提醒许东不需要写进毕业论文 , 许东就在草稿上继续写 。
现在看来 , 尽管那些猜想称不上科研 , 甚至没什么价值 , 却在无意中锻炼了许东举一反三、触类旁通的能力 。 这是一种天赋 , 冥冥之中决定了他将终生与理论研究打交道 。
一生中最重要的导师许东博士就读于美国的伊利诺伊大学厄巴纳—香槟分校(UniversityofIllinoisatUrbana-Champaign , UIUC) , 但前面还有段小序曲 。
1990年 , 许东硕士毕业后 , 来到美国纽约市立大学皇后学院读起了物理博士 。 但因为当时女朋友(现在的妻子)读研选在了UIUC , 许东果断转校 。 次年5月 , 许东向西出发 , 跨越千里与爱人会和 。
他与妻子在北大结识 , 妻子就读于化学系 , 比他小三届 , 两人从相恋时就约定去更远的地方 , 从北大到UIUC , 两所学校成了二人从相识到婚姻的重要见证 。
这段经历有一位见证人——许东的博士导师KlausJ.Schulten教授 , 也是许东一生中最重要的一位导师 。
许东的「AI生命科学」进化史:从90年代泡沫繁荣,到深度学习复兴
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KlausJ.Schulten教授
Klaus是一位理论物理学家、也是一位计算生物学家 , 博士师从诺贝奖获得者MartinKarplus(从学术脉络上看 , 现在深圳湾实验室周耀旗的博士后导师也是MartinKarplus , 与许东一脉相承) 。
早在1978年 , Klaus就较为完整地描述了磁感应和动物迁徙的RadicalPair假说(也称为化学指南针假说) , 此后便投身到生物学领域 。
1991年许东加入时 , Klaus实验室已经非常活跃 , 他本人是UIUC里最抢手的导师之一 。 许东的导师首选是Klaus 。
但进入Klaus组里 , 许东觉得多少沾了些运气 。
UIUC有一个重要的导师双选机制 , 学生可以和许多导师单独见面 , 由学生提交5个导师的排序志愿 , 导师也排序选择5个和他(她)见过面的学生交到系里 , 由系里协调分配 。
所以 , 这份实力和运气兼具的选择机制总会伴随意外和惊喜 。
谈到被选的原因 , 许东猜测 , 或许是自己初到UIUC时一次性通过了博士资格考试 , 一下子让Klaus注意到了 。 但其他同学就没有这么幸运了 , 很多美国同学在这场入学考试中表现吃力 , 或者没有参加 , 两次补考也有一半的博士生没有通过考试 , 被降为了硕士 。
时至今日 , 谈起选择导师时的经历 , 许东还深有感慨 , “我们是选择了彼此 , 夸张点说 , 师生关系对职业的发展可能不亚于配偶关系 。 ”
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许东博士毕业时和KlausJ.Schulten教授的合影
进了Klaus组之后 , 许东在校内的贝克曼研究所(BeckmanInstitute)做研究 。
这是伊利诺伊大学里一栋专门为跨学科研究而建设的大楼 , 主要集中在工程和物理科学、生命和行为科学方面的研究 , 超越了当时众多传统大学在组织和结构方面所存在的众多内在局限性 , 一切服务于跨学科交流 。
在那里 , 许东第一次同时运用起“生物、计算机、物理”三门学科的知识 。
对许东来讲 , 最难的还是补上生物的背景 。 组里的同学一起成立了“学习小组” , 一起读沃森等人写的《细胞分子生物学》一书 , 每人轮流负责主讲一章 , 相互交流学习笔记 。 只用了半年 , 许东连同组的同学 , 都补上了生物知识 。